Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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