Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR3Q13615 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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