Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms