Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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