Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF1Q12946 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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