Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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