Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TROQ12816 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TROQ12816 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TROQ12816 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TROQ12816 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TROQ12816 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TROQ12816 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TROQ12816 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TROQ12816 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TROQ12816 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TROQ12816 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TROQ12816 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TROQ12816 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TROQ12816 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TROQ12816 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TROQ12816 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TROQ12816 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TROQ12816 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TROQ12816 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TROQ12816 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TROQ12816 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TROQ12816 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TROQ12816 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TROQ12816 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TROQ12816 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TROQ12816 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TROQ12816 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TROQ12816 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
TROQ12816 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
TROQ12816 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TROQ12816 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TROQ12816 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TROQ12816 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TROQ12816 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TROQ12816 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TROQ12816 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TROQ12816 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TROQ12816 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TROQ12816 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TROQ12816 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TROQ12816 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TROQ12816 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TROQ12816 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TROQ12816 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TROQ12816 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TROQ12816 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TROQ12816 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TROQ12816 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TROQ12816 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TROQ12816 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TROQ12816 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TROQ12816 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TROQ12816 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TROQ12816 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TROQ12816 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TROQ12816 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TROQ12816 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TROQ12816 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TROQ12816 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TROQ12816 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TROQ12816 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TROQ12816 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TROQ12816 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TROQ12816 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TROQ12816 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TROQ12816 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TROQ12816 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TROQ12816 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TROQ12816 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TROQ12816 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
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