Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 RNH201YNL072W 924 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YGK3YOL128C 1128 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YOR331CYOR331C 558 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 QDR3YBR043C 2070 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SEC2YNL272C 2280 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 RIM4YHL024W 2142 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SPB4YFL002C 1821 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 AEP3YPL005W 1821 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 ALE1YOR175C 1860 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YOS1YER074W-A 258 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YGR265WYGR265W 411 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YIL054WYIL054W 318 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 UTP11YKL099C 753 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YAR075WYAR075W 474 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 RIB1YBL033C 1038 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 MRPL19YNL185C 477 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 HCH1YNL281W 462 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 RTS1YOR014W 2274 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 ABZ1YNR033W 2364 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SWC4YGR002C 1431 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 UBX5YDR330W 1503 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 CHA4YLR098C 1947 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 CDC14YFR028C 1656 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 IMG1YCR046C 510 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YDR115WYDR115W 318 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YIA6YIL006W 1122 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 ASK1YKL052C 879 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YCL022CYCL022C 516 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 UGA1YGR019W 1416 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 NTF2YER009W 378 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 PGA3YML125C 939 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SGF29YCL010C 780 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 MAG2YLR427W 2013 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 DAL5YJR152W 1632 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 TPO5YKL174C 1857 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 ATG20YDL113C 1923 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 HOM2YDR158W 1098 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YDR355CYDR355C 303 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 VOA1YGR106C 798 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YGR190CYGR190C 366 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 CYS3YAL012W 1185 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 VPS63YLR261C 327 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 RPS10AYOR293W 318 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SET5YHR207C 1581 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 TOG1YER184C 2385 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 GPD1YDL022W 1176 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 PEX29YDR479C 1665 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 GAL83YER027C 1254 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YHK8YHR048W 1545 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 NBL1YHR199C-A 222 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 ERG3YLR056W 1098 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 ACS2YLR153C 2052 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 NRM1YNR009W 750 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 CIN5YOR028C 888 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 ATP3YBR039W 936 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YPL276WYPL276W 438 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YPR096CYPR096C 303 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 HSP78YDR258C 2436 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 DBF2YGR092W 1719 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 BFR1YOR198C 1413 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YCR050CYCR050C 309 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 BSC2YDR275W 708 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 MTM1YGR257C 1101 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 RPL39YJL189W 156 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 MRPL38YKL170W 417 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 YLR434CYLR434C 384 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 HHT2YNL031C 411 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 ERP4YOR016C 624 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 RPS11BYBR048W 471 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 AFT2YPL202C 1251 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 ARX1YDR101C 1782 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 POL4YCR014C 1749 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 CTS1YLR286C 1689 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 TUL1YKL034W 2277 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 MCM3YEL032W 2916 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YFL032WYFL032W 321 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 PCL5YHR071W 690 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 VTI1YMR197C 654 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SCW10YMR305C 1170 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YNL205CYNL205C 423 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 MRPS18YNL306W 654 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YPL107WYPL107W 747 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YAR1YPL239W 603 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YLR152CYLR152C 1731 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 HRD1YOL013C 1656 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 HSF1YGL073W 2502 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 LST4YKL176C 2487 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YNR063WYNR063W 1824 nt5.07□□□□□ -1.6
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