Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 MPC3YGR243W 441 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YIL161WYIL161W 708 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SAW1YAL027W 786 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 UTP11YKL099C 753 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 MRPL20YKR085C 588 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RPN13YLR421C 471 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 ASI2YNL159C 870 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 CDC40YDR364C 1368 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RPO21YDL140C 5202 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SPT10YJL127C 1923 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 AIM11YER093C-A 414 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RPS8BYER102W 603 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 BCD1YHR040W 1101 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RPC37YKR025W 849 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SEC65YML105C 822 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RPS8AYBL072C 603 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YOR342CYOR342C 960 nt3.32□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 ARG5,6YER069W 2592 nt3.31□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 MSW1YDR268W 1140 nt3.31□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 VMA8YEL051W 771 nt3.31□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 MPS2YGL075C 1164 nt3.31□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YJR071WYJR071W 369 nt3.31□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.31□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YKL162CYKL162C 1209 nt3.31□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 FRE2YKL220C 2136 nt3.31□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 EXO70YJL085W 1872 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SEC27YGL137W 2670 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 FUN30YAL019W 3396 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RRI1YDL216C 1323 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RAD55YDR076W 1221 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RMT2YDR465C 1239 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SDS3YIL084C 984 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YNL109WYNL109W 546 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RSM19YNR037C 276 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SSP2YOR242C 1116 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 PPT2YPL148C 522 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SPP381YBR152W 876 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RED1YLR263W 2484 nt3.3□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 FLO1YAR050W 4614 nt3.29□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RRP14YKL082C 1305 nt3.29□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SKG1YKR100C 1068 nt3.29□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 COX19YLL018C-A 297 nt3.29□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 CTL1YMR180C 963 nt3.29□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 ERG2YMR202W 669 nt3.29□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YOL118CYOL118C 309 nt3.29□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RET3YPL010W 570 nt3.29□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 GYL1YMR192W 2163 nt3.29□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 EPL1YFL024C 2499 nt3.29□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 TOM70YNL121C 1854 nt3.28□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 VTC4YJL012C 2166 nt3.28□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RAX2YLR084C 3663 nt3.28□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 NOP4YPL043W 2058 nt3.28□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 IPI3YNL182C 1668 nt3.28□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YFL051CYFL051C 483 nt3.28□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 PAU13YHL046C 363 nt3.28□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 ENV10YLR065C 546 nt3.28□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 BET5YML077W 480 nt3.28□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SSN8YNL025C 972 nt3.28□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 ENP2YGR145W 2124 nt3.28□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 IRC3YDR332W 2070 nt3.28□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 RSN1YMR266W 2862 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 KIN3YAR018C 1308 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 THO1YER063W 657 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 CNN1YFR046C 1086 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 PRP18YGR006W 756 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 SCM4YGR049W 564 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 TMA19YKL056C 504 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YLR230WYLR230W 306 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YLR400WYLR400W 474 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YBR137WYBR137W 540 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 RRP7YCL031C 894 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 MTL1YGR023W 1656 nt3.27□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YCG1YDR325W 3108 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 MNT3YIL014W 1893 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 RPA14YDR156W 414 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 PPE1YHR075C 1203 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 TIR2YOR010C 756 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 PFY1YOR122C 381 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 NFT1YKR103W 3657 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 RPA135YPR010C 3612 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 MPS1YDL028C 2295 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 TCB3YML072C 4638 nt3.26□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 PSK1YAL017W 4071 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YGR073CYGR073C 372 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 CDC12YHR107C 1224 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 PFS1YHR185C 714 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 MMF1YIL051C 438 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 RGI2YIL057C 495 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 RPL17AYKL180W 555 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 GTT2YLL060C 702 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 HMX1YLR205C 954 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YMR087WYMR087W 855 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 APD1YBR151W 951 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 MDN1YLR106C 14733 nt3.25□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 CBP2YHL038C 1893 nt3.24□□□□□ -1.89
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