Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	ESL1	YIL151C	3357 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	FUN30	YAL019W	3396 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	DUF1	YOL087C	3351 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	NUF2	YOL069W	1356 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	FRE2	YKL220C	2136 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RAX2	YLR084C	3663 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	ITC1	YGL133W	3795 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	NDT80	YHR124W	1884 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	ERG11	YHR007C	1593 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	RRG1	YDR065W	1098 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YDR355C	YDR355C	303 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	IME1	YJR094C	1083 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YLR042C	YLR042C	486 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	SUR1	YPL057C	1149 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YAT2	YER024W	2772 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	CDC40	YDR364C	1368 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	YIG1	YPL201C	1386 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	MSM1	YGR171C	1728 nt		2.96	□□□□□ -1.93
VIK1	Q12045	CDC20	YGL116W	1833 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	DBP5	YOR046C	1449 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	RRP17	YDR412W	708 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	AML1	YGR001C	747 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	DAL2	YIR029W	1032 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	SAW1	YAL027W	786 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	SDH3	YKL141W	597 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YKL162C	YKL162C	1209 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	RLP7	YNL002C	969 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	SSP2	YOR242C	1116 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	NIP7	YPL211W	546 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	DIM1	YPL266W	957 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	RSN1	YMR266W	2862 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	BPT1	YLL015W	4680 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	SRB8	YCR081W	4284 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	CEP3	YMR168C	1827 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	AEP3	YPL005W	1821 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	MON1	YGL124C	1935 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	AKR1	YDR264C	2295 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	CTM1	YHR109W	1758 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YJR071W	YJR071W	369 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YLR230W	YLR230W	306 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	REC102	YLR329W	795 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	POP8	YBL018C	402 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	HUB1	YNR032C-A	222 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YOR114W	YOR114W	885 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YPR078C	YPR078C	1119 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	MRPL27	YBR282W	441 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	PFF1	YBR074W	2931 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	REG1	YDR028C	3045 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YOR365C	YOR365C	2112 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	CHS3	YBR023C	3498 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	ALG8	YOR067C	1734 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YCR024C-B	YCR024C-B	267 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	BSC2	YDR275W	708 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	SOL3	YHR163W	750 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	DCG1	YIR030C	735 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YJR128W	YJR128W	360 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	TIF34	YMR146C	1044 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YNL171C	YNL171C	369 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	PPT2	YPL148C	522 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YPR136C	YPR136C	513 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	PHO88	YBR106W	567 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YTA7	YGR270W	4140 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	CBP2	YHL038C	1893 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	TOM70	YNL121C	1854 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	MYO5	YMR109W	3660 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	TOM1	YDR457W	9807 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	PDC2	YDR081C	2778 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	NOP4	YPL043W	2058 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	RPL35B	YDL136W	363 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	KXD1	YGL079W	657 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	MPC1	YGL080W	393 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YHR086W-A	YHR086W-A	162 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	SDS3	YIL084C	984 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	GLG2	YJL137C	1143 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	PBA1	YLR199C	831 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	ATG16	YMR159C	453 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YNL035C	YNL035C	1170 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	FKH2	YNL068C	2589 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YDR340W	YDR340W	303 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YDR535C	YDR535C	501 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	MRPL49	YJL096W	486 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	CPR7	YJR032W	1182 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	GAB1	YLR459W	1185 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	HHF2	YNL030W	312 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	IMP4	YNL075W	873 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	TRM112	YNR046W	408 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	HHF1	YBR009C	312 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	ATG5	YPL149W	885 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	SUT2	YPR009W	807 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	YPR027C	YPR027C	834 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	RRP7	YCL031C	894 nt		2.92	□□□□□ -1.94

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