Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms