Protein–RNA interactions for Protein: Q08285

RRP40, Exosome complex component RRP40, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP40Q08285 RPL15AYLR029C 615 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 RIM9YMR063W 720 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 FUN30YAL019W 3396 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 NDT80YHR124W 1884 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 RAX2YLR084C 3663 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 FLO1YAR050W 4614 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 SRC1YML034W 2505 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 TLC1TLC1 1301 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 MRH1YDR033W 963 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 APA2YDR530C 978 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 SAY1YGR263C 1275 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 SEC14YMR079W 915 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 YMR310CYMR310C 954 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 SSU72YNL222W 621 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 CAT5YOR125C 702 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 YBR053CYBR053C 1077 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 YBR089WYBR089W 600 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 XRN1YGL173C 4587 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 YOR365CYOR365C 2112 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 RMT2YDR465C 1239 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 RPL23BYER117W 414 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 DAL2YIR029W 1032 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 SUR1YPL057C 1149 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 VPS30YPL120W 1674 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP40Q08285 SEC27YGL137W 2670 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 COM2YER130C 1332 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 BMH2YDR099W 822 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 CGR1YGL029W 363 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 RPL1BYGL135W 654 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 RPS23AYGR118W 438 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YJR128WYJR128W 360 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 SDH3YKL141W 597 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 RPL8BYLL045C 771 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 COA4YLR218C 453 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YLR230WYLR230W 306 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 RPL6AYML073C 531 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YBL096CYBL096C 309 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 REG2YBR050C 1017 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 RPL1AYPL220W 654 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YPR078CYPR078C 1119 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 RPS23BYPR132W 438 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 PBI1YPL272C 1554 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 ATP25YMR098C 1839 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 DYN1YKR054C 12279 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 UBP14YBR058C 2346 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 KRE2YDR483W 1329 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 HMF1YER057C 390 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 SPT2YER161C 1002 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YGR017WYGR017W 894 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 ATP12YJL180C 978 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 SFH1YLR321C 1281 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YMR087WYMR087W 855 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 COS1YNL336W 1146 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 DIM1YPL266W 957 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YSA1YBR111C 696 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YCR015CYCR015C 954 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YPR1YDR368W 939 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 ADH4YGL256W 1149 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YHL045WYHL045W 348 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 MBB1YJL199C 327 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 SDO1YLR022C 753 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YLR416CYLR416C 399 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 SEC65YML105C 822 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 HHF1YBR009C 312 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 HNT3YOR258W 654 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 TAF3YPL011C 1062 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 PHO81YGR233C 3537 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 GCD6YDR211W 2139 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 MSS4YDR208W 2340 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 DBP7YKR024C 2229 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 STE24YJR117W 1362 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 PLM2YDR501W 1566 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 ILS1YBL076C 3219 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 MIP6YHR015W 1980 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 FRE2YKL220C 2136 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 EBS1YDR206W 2655 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YDR222WYDR222W 1248 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 EMC2YJR088C 879 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 IME1YJR094C 1083 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 RSM26YJR101W 801 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 NIT3YLR351C 876 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 BLS1YLR408C 369 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YPR050CYPR050C 414 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 MON1YGL124C 1935 nt2.74□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YIL169CYIL169C 2988 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 PMR1YGL167C 2853 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 JIP5YPR169W 1479 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 RDI1YDL135C 609 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YDR290WYDR290W 330 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 IZH1YDR492W 951 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 DDI2YFL061W 678 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 QCR10YHR001W-A 234 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 YLR297WYLR297W 390 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 SMA2YML066C 1110 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 DDI3YNL335W 678 nt2.73□□□□□ -1.97
RRP40Q08285 TUM1YOR251C 915 nt2.73□□□□□ -1.97
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