Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNK2Q07912 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms