Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBQ06643 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBQ06643 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBQ06643 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBQ06643 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBQ06643 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBQ06643 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBQ06643 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBQ06643 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBQ06643 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBQ06643 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBQ06643 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBQ06643 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBQ06643 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBQ06643 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBQ06643 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBQ06643 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBQ06643 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBQ06643 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBQ06643 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBQ06643 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBQ06643 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBQ06643 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBQ06643 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms