Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR4Q05215 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR4Q05215 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms