Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms