Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms