Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA4Q00056 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms