Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms