Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFM1P61960 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFM1P61960 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFM1P61960 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFM1P61960 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFM1P61960 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFM1P61960 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFM1P61960 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFM1P61960 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFM1P61960 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFM1P61960 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFM1P61960 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFM1P61960 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFM1P61960 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFM1P61960 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFM1P61960 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms