Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP25P60880 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms