Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms