Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO3P55854 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO3P55854 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms