Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPD2P43304 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPD2P43304 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPD2P43304 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPD2P43304 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPD2P43304 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPD2P43304 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPD2P43304 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPD2P43304 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPD2P43304 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPD2P43304 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPD2P43304 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPD2P43304 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPD2P43304 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms