Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX2P40425 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX2P40425 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX2P40425 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX2P40425 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX2P40425 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX2P40425 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX2P40425 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX2P40425 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX2P40425 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX2P40425 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX2P40425 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX2P40425 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX2P40425 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX2P40425 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX2P40425 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX2P40425 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX2P40425 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX2P40425 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX2P40425 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX2P40425 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX2P40425 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX2P40425 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX2P40425 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX2P40425 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX2P40425 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX2P40425 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX2P40425 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms