Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPCAL1P37235 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPCAL1P37235 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms