Protein–RNA interactions for Protein: P36104

SWD2, COMPASS component SWD2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWD2P36104 RFC3YNL290W 1023 nt2.86□□□□□ -1.95
SWD2P36104 RSC1YGR056W 2787 nt2.86□□□□□ -1.95
SWD2P36104 SST2YLR452C 2097 nt2.86□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YDL176WYDL176W 2127 nt2.86□□□□□ -1.95
SWD2P36104 SMC2YFR031C 3513 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 EMP70YLR083C 2004 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YGL138CYGL138C 1038 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YGR039WYGR039W 312 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 MDV1YJL112W 2145 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YKR011CYKR011C 1062 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 RPL22AYLR061W 366 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YOR062CYOR062C 807 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 POL30YBR088C 777 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 VTC4YJL012C 2166 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YNR066CYNR066C 1311 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 CDC40YDR364C 1368 nt2.85□□□□□ -1.95
SWD2P36104 RRP5YMR229C 5190 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 RAD55YDR076W 1221 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YDR133CYDR133C 336 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YEL075CYEL075C 369 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 ECO1YFR027W 846 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 MTC3YGL226W 372 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 PPE1YHR075C 1203 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 GAB1YLR459W 1185 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YNL320WYNL320W 855 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 YOL118CYOL118C 309 nt2.84□□□□□ -1.95
SWD2P36104 VPS3YDR495C 3036 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 AIM11YER093C-A 414 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 RPL30YGL030W 318 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 USE1YGL098W 738 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 YGR073CYGR073C 372 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 RIF2YLR453C 1188 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 ATG16YMR159C 453 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 AAR2YBL074C 1068 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 PFY1YOR122C 381 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 MCT1YOR221C 1083 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 APD1YBR151W 951 nt2.83□□□□□ -1.96
SWD2P36104 MSH2YOL090W 2895 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 SQS1YNL224C 2304 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 FLO9YAL063C 3969 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 HIM1YDR317W 1245 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 YVH1YIR026C 1095 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 RPS28BYLR264W 204 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 YMR141CYMR141C 309 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 CTL1YMR180C 963 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 KIN3YAR018C 1308 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 UBP8YMR223W 1416 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 ARP4YJL081C 1470 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 MYO5YMR109W 3660 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 TCP1YDR212W 1680 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 CDH1YGL003C 1701 nt2.82□□□□□ -1.96
SWD2P36104 WHI3YNL197C 1986 nt2.81□□□□□ -1.96
SWD2P36104 RPS14AYCR031C 414 nt2.81□□□□□ -1.96
SWD2P36104 BRR6YGL247W 594 nt2.81□□□□□ -1.96
SWD2P36104 PFS1YHR185C 714 nt2.81□□□□□ -1.96
SWD2P36104 GOT1YMR292W 417 nt2.81□□□□□ -1.96
SWD2P36104 YNL109WYNL109W 546 nt2.81□□□□□ -1.96
SWD2P36104 ERV15YBR210W 429 nt2.81□□□□□ -1.96
SWD2P36104 AKR1YDR264C 2295 nt2.81□□□□□ -1.96
SWD2P36104 SIZ1YDR409W 2715 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 GCN1YGL195W 8019 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 SPP382YLR424W 2127 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 MPS2YGL075C 1164 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 MMF1YIL051C 438 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 RPC37YKR025W 849 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 GTT2YLL060C 702 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 ENV10YLR065C 546 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 RPN13YLR421C 471 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 TIF34YMR146C 1044 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 ICS2YBR157C 768 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 HFM1YGL251C 3564 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 ENP2YGR145W 2124 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 VAS1YGR094W 3315 nt2.8□□□□□ -1.96
SWD2P36104 YDR131CYDR131C 1671 nt2.79□□□□□ -1.96
SWD2P36104 SUP45YBR143C 1314 nt2.79□□□□□ -1.96
SWD2P36104 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.79□□□□□ -1.96
SWD2P36104 YLL037WYLL037W 381 nt2.79□□□□□ -1.96
SWD2P36104 TEM1YML064C 738 nt2.79□□□□□ -1.96
SWD2P36104 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.7 ms