Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPB2P35606 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPB2P35606 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPB2P35606 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB2P35606 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB2P35606 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB2P35606 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB2P35606 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB2P35606 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB2P35606 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB2P35606 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB2P35606 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB2P35606 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB2P35606 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB2P35606 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB2P35606 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB2P35606 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB2P35606 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB2P35606 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB2P35606 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms