Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCK1P35558 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCK1P35558 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCK1P35558 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK1P35558 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK1P35558 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCK1P35558 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCK1P35558 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCK1P35558 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCK1P35558 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCK1P35558 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCK1P35558 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCK1P35558 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCK1P35558 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCK1P35558 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCK1P35558 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCK1P35558 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK1P35558 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK1P35558 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK1P35558 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK1P35558 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK1P35558 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK1P35558 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK1P35558 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK1P35558 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK1P35558 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK1P35558 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK1P35558 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms