Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD9P28356 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD9P28356 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms