Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms