Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GM2AP17900 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GM2AP17900 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GM2AP17900 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GM2AP17900 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GM2AP17900 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GM2AP17900 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GM2AP17900 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GM2AP17900 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GM2AP17900 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GM2AP17900 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms