Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA4P13612 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms