Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DMDP11532 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DMDP11532 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DMDP11532 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DMDP11532 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DMDP11532 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DMDP11532 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DMDP11532 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DMDP11532 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DMDP11532 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DMDP11532 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DMDP11532 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DMDP11532 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DMDP11532 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DMDP11532 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DMDP11532 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DMDP11532 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DMDP11532 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DMDP11532 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DMDP11532 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DMDP11532 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DMDP11532 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms