Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PKHD1P08F94 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PKHD1P08F94 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PKHD1P08F94 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PKHD1P08F94 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PKHD1P08F94 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PKHD1P08F94 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PKHD1P08F94 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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