Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGGP02679 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGGP02679 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGGP02679 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGGP02679 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGGP02679 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGGP02679 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGGP02679 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGGP02679 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGGP02679 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGGP02679 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms