Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P00740 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P00740 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P00740 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F9P00740 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
F9P00740 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F9P00740 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
F9P00740 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F9P00740 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F9P00740 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P00740 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P00740 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P00740 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P00740 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P00740 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P00740 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P00740 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms