Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL1O95922 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms