Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24BO95487 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms