Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms