Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM44O43615 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms