Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNQ2O43526 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms