Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COCHO43405 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COCHO43405 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COCHO43405 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COCHO43405 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COCHO43405 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COCHO43405 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COCHO43405 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COCHO43405 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COCHO43405 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COCHO43405 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms