Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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