Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHADO15335 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHADO15335 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHADO15335 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHADO15335 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHADO15335 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHADO15335 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHADO15335 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHADO15335 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHADO15335 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHADO15335 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHADO15335 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHADO15335 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHADO15335 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHADO15335 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHADO15335 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHADO15335 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHADO15335 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms