Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms