Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
O00370 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
O00370 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
O00370 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
O00370 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
O00370 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
O00370 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
O00370 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
O00370 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
O00370 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
O00370 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms