Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
I3L3M4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
I3L3M4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
I3L3M4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
I3L3M4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
I3L3M4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
I3L3M4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
I3L3M4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
I3L3M4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
I3L3M4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
I3L3M4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms