Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms