Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms